1、砭石疗法在患部的操作：于患部体表处施以相应手法，如腰肌劳损引起的疼痛，可在腰部痛处施以刮、擦、滚、刺等手法，治疗时间20~30分钟。
2、砭石疗法远处穴位的操作：除在患部操作，还选择病灶所在经脉通达的远端穴位进行操作，如腰痛除刮擦腰部痛处外，还可压、刺、刮帼窝的委中或内踝上方的交信穴。
3、砭石疗法循经操作：沿病灶所在经脉上下大范围施以手法，可起到良好的疏通经络的作用，如膝关节炎，在膝关节周围用刮、擦、划、刺等手法外，沿膝盖上至大腿根部，向下至踝关节，均应进行刮、擦等操作，可起到更好疗效。
4、砭石疗法对侧操作：除在患部的操作外，还应在患部对侧相应部位施以手法，可起到沟通左右气血，达到整体调节的作用。如三叉神经痛、面神经麻痹或痉挛，先在患侧局部及风池、翳风等穴施以刮、擦、划、刺等手法，后在健侧面部相应部位及穴位施以相同手法，可加快疾病愈合。