砭术在治疗各科疾病时均体现辨证论治的原则。同时又证症同治、病证同治、病症同治。
一、证症同治
砭术治疗内科疾病，以辨证分型，对证而治。以证为主，顾及症状。例如风湿咳嗽，大便秘结。砭术治法以宣肺止咳，清热散风为主，同时根据便秘这一症状，加之通便的治法，这就是证症同治。
二、病证同治
病名不能体现证候，但有些疾病的治疗是以病为主要依据来确定治疗方案的。例如糖尿病，有气虚证、阴虚证，或在脾、或在肾……砭术治疗以治病为主，兼顾辨证分型。基本操作以刺激与胰腺有关的腧穴、经络为主，再针对气虚或阴虚等证施治，因此称为病证同治。
三、病症同治
砭术在治疗骨伤科病症时，只辨病不辨证。例如颈椎病，采用西医分型，对不同分型使用不同手法治疗。同时兼顾消除手麻、头晕、恶心等症状，这种治疗方法叫做病症同治。
综上所述，砭术的治疗原则离不开中医学总原则——整体观念和辨证论治。同时在治疗疾病过程中更充分地体现总原则，发挥砭术特长，在经络学应用上弥补了针灸之不足，使之全面发挥其优势。